Это несклоняемая аббревиатура, мн. ч.
В единственном числе правильны оба варианта: клипса (женский род) и клипс (мужской род).
Слово мужского рода, склоняются обе части: нет выставленного счёта-оферты и т. д.
Запятая не требуется. Подробнее – в "Справочнике по пунктуации".
Буквенные аббревиатуры инициального типа в первой стадии своего образования имеют род стержневого слова: ИГИЛ стало (средний род по опорному слову государство); корректно согласование и в женском роде, если родовым словом считать слово организация: ИГИЛ (террористическая организация) запрещена в России.
Но и мужской род совсем исключать нельзя. Ведь чем чаще употребляется аббревиатура, чем более привычной она становится, тем больше вероятность, что она оторвется от соответствующего полного наименования и приобретет свойства обычного слова с иной родовой характеристикой. Так произошло, например, с аббревиатурами МИД, ЗАГС, которые приобрели форму мужского рода, хотя опорные слова принадлежат к другому роду (министерство, запись). Поэтому согласование с ИГИЛ определений и сказуемых в мужском роде тем вероятнее, чем чаще и дольше будет употребляться это сочетание.
В связи с тем что – сложный союз, запятая перед что ставится при его интонационном распадении на две части.
Предложение составлено некорректно, его следует перестроить.