И слитное, и раздельное написание верно.
Верно: одних — трех суток.
Верно: не поставленный в срок товар.
Корректно: срок годности неограничен.
Постановка знаков препинания в предложении корректна. Ср. примечание к параграфу 42.3 справочника по пунктуации Д. Э. Розенталя:
Сравнительный оборот союзом как, находящийся в середине предложения, отделяется запятой, если нужно показать, к какой части предложения он относится: Я почувствовал на моих волосах прикосновение слабой, как лист дрожавшей руки (Т.) — не «слабой, как лист», а «дрожавшей, как лист»; Я мчался на лихом коне, как ветер волен и один — не «мчался, как ветер», а «волен и один, как ветер»...
Корректно употребление предлога на: дом на холмах, провести лето на холмах.
Д. Э. Розенталь пишет, что употребление предлога в в пространственном значении связано с представлением об ограниченном пространстве, а при отсутствии этого значения употребляется предлог на (холмы — местность без точно очерченных границ).
Верно: Срок оказания услуг — от 15 до 31 рабочего дня.
Постановка запятой не требуется.
Фраза некорректна. Можно сказать: приговорен к лишению свободы сроком на...
Запятые в Вашем предложении не нужны.