Правильно дефисное написание. «Большой толковый словарь русского языка» не учитывает многих закономерностей, выявленных орфографистами в последние годы и десятилетия. В вопросах правописания следует ориентироваться на орфографический словарь, а не на толковый.

Склонение мужской фамилии Коток обязательно. Фамилию можно склонять двояким образом: с выпадением гласного (Котка, Котку и т. д.) и с сохранением гласного (Котока, Котоку и т. д.). Решение о типе склонения принимает носитель фамилии, но предпочтителен второй вариант (с сохранением гласного), так как в этом случае из косвенных форм легко вывести начальную форму фамилии.

Знаки препинания расставлены корректно.

Запятая после сочинительного союза и нужна, поскольку подчинительный союз когда не имеет второй части. Обратите внимание, что сочетание топ-три (топ-3) пишется через дефис.

Действительно, инфинитив названного глагола — кишеть. Этот глагол второго спряжения, что определяется по ударным личным окончаниям (кишит, кишат). При определении спряжения инфинитив берется во внимание только у глаголов с безударными личными окончаниями. См. также «горячий вопрос» номер 10.

Отглагольное прилагательное пишется с одной н: званый ужин.

Постановка запятой в этом случае факультативна, окончательное решение принимает автор текста. А вот если придаточная часть состоит из одного только союзного слова, запятая не ставится: В комнате пахло чем-то странным, но он не мог понять чем.

Такую фамилию лучше склонять с сохранением гласного, чтобы из форм косвенных падежей можно было безошибочно восстановить форму именительного падежа: Козачёк, Козачёка, Козачёку, Козачёка, Козачёком, о Козачёке.

Правильно: в строку́. И только в устойчивых выражениях не всякое лыко в стро́ку, ставить всякое лыко в стро́ку ударение падает на о.

Оргединица — это сложносокращенное слово (от организационная единица). Сложносокращенные слова пишутся слитно, ср.: загранпаспорт, стенгазета, хозтовары.