Разница в написании связана с тем, что ночёвка образовано от глагола (ночевать), а не от существительного. Буква о пишется в суффиксе -овк- существительных, образованных от существительных и прилагательных. Буква ё пишется в суффиксе -ёвк- существительных, образованных от глаголов.
Если продукт томился вместе с овощами, то верно: томленный с овощами. Если продукт сначала томили, а потом уже положили овощи, то верно: томленый с овощами.
Слово пока не включено в академический орфографический словарь, но встречается в «Большой российской энциклопедии» в форме кесадилья. Это написание уже достаточно распространено, произношение в соответствии с данным написанием удобно для носителя русского языка. В ожидании фиксации в орфографическом словаре можно ориентироваться на написание БРЭ.
Можно не обособлять (в знач. 'на тот же поднос').
