Правильно: цунами. Написание, которое Вы увидели, нарушает орфографическую норму. Возможно, это языковая игра или просто орфографическая ошибка.
Да, верно.
Фамилия Муха склоняется так же, как и соответствующее нарицательное существительное: Мухи, Мухе, Муху и т. д.
В современном русском языке эти слова однокоренными не считаются. Однако с исторической точки зрения они восходят к одному корню: изначально существительное мошка обозначало «маленькую муху», но со временем стало использоваться для обозначения другого типа насекомых (мелкого гнуса).
1. Запятая нужна.
2. Правильно со строчных букв: астафьевская, шукшинская, евдокимовская деревня.
Лучше: руководить объединенными первым и вторым цехами.
Лучше поставить двоеточие: Они замерли, как были: один сжался в комок, другой закрыл лицо руками. Ваш вариант пунктуации тоже возможен.
Запятая не ставится.