Присоединительный союз в том числе употреблен некорректно. Его функция – обозначать, выделять предмет, на который среди прочего распространяется сказанное в предыдущей части. См. «Справочник по пунктуации». 

Оборот с предлогом согласно здесь выполняет функцию вводного сочетания, поскольку указывает на источник информации. Запятая после него нужна: Согласно А. А. Пушкину, «цитата».

Окончательный выбор – за носителем фамилии, но предпочтительно всегда склонять без выпадения гласного, т. к. фамилии выполняют в т. ч. юридическую функцию: Шелепеня, Шелепеню и т. д.

Эти слова обычно выполняют функцию союза и не обособляются, хотя иногда их выделяют как вводные при соответствующей интонации: Все пришли вовремя. Петя опоздал, тем не менее.

В этом предложении сравнительный оборот как будто во сне выполняет функцию сказуемого при подлежащем всё, поэтому запятая не нужна (запятая между подлежащим и сказуемым не ставится).

Сочетание явно родом откуда-то с юга выполняет функцию несогласованного определения при существительном человек, уже имеющем при себе согласованное определение высокий. В таких случаях несогласованное определение обособляется.

Склоняется только мужская фамилия. В дательном падеже возможно: Воробью и Воробею. Предпочтительно склонять без выпадения гласного (т. е. Воробею), поскольку фамилии выполняют в том числе юридическую функцию.

Да, в большинстве случаев впрочем выполняет функцию вводного слова и обособляется. Однако иногда впрочем может выступать в роли союза, в таком случае запятая ставится только перед впрочем.

Написание Министерство здравоохранения соответствует правилу: с прописной буквы пишется первое слово в официальном названии учреждения, организации, предприятия. Функция прописной буквы – не придать «важность» слову, а маркировать имя собственное.

Оба варианта возможны. Предпочтительно склонять фамилию без выпадения гласного (Семенока, Семеноку), поскольку фамилии выполняют в том числе юридическую функцию. Но окончательное решение о типе склонения принимает носитель фамилии.