Пунктуационное оформление корректно.
Корректно: Да и по сути, никакой изоляции в этом месте не существует.
Запятая не нужна. Оборот с как не обособляется, если входит в состав сказуемого или тесно связан с ним по смыслу.
Вторая запятая не требуется: В третьем, окончательном чтении...
Указанная запятая нужна.
Склоняется мужская фамилия (как существительное второго склонения, например, как канал).
Предпочтительно: Костючоку (без выпадения гласного). Склоняется только мужская фамилия.
Слово кофе не изменяется по падежам, а вот устарелое кофей - склоняется, поэтому выражение угостила кофеем (кофейком) принципиально возможно.
Кавычки нужны. Заключаются в кавычки условные названия продовольственных, парфюмерных и иных товаров.
Правильно с одной точкой: ед./с (с без точки).