Все три выражения допустимы. Какое из них выбрать — решать самому автору, безусловно с учетом того замысла, какой требуется воплотить в словесном соединении.

Корректно слитное написание: В прошлом месяце у 3 подрядчиков неизрасходованными остались 10 тысяч рублей (= остались (когда?) в прошлом месяце; остались (у кого?) у 3 подрядчиков; остались (какими?) неизрасходованными).

Язык изменяется. Существительные, оканчивающиеся на мягкий согласный, исторически принадлежали к разным типам склонения в зависимости от их происхождения. С течением веков количество типов склонения сократилось, и принадлежность существительных с основой на мягкий согласный к тому или иному типу склонения теперь зависит от их грамматического рода. Причем и род таких существительных мог меняться на протяжении веков: так, слово лебедь два века назад было существительным женского рода (лебедь белая плывет у Пушкина), а слово рояль относилось к женскому роду еще в начале ХХ века (почему и писали об умении играть на рояли). Умение определять род существительных такого типа относится не столько к грамматике, сколько к культуре речи.

Предложения что... пассажирам придётся идти пешком и что при плохих погодных условиях рейс выполняться не будет однородны (оба они относятся к глаголу предупредил). Наличие соотносительного то всего лишь мешает постановке запятой на месте (2).