Правильно: в количестве 31 коробки и 15 папок.
Оба варианта верны.
Это так называемое эллиптическое предложение (самостоятельно употребляемое предложение с отсутствующим сказуемым). В таких предложениях при наличии паузы ставится тире, при отсутствии паузы знак не нужен.
Правильно: площадью 48,7 квадратного метра. Существительным управляет дробная часть: семь десятых квадратного метра.
Тире ставится в предложениях, состоящих из двух компонентов со значением субъекта, объекта, обстоятельства (в разных сочетаниях) и построенных по схемам: «кто — кому», «кто — где», «что — кому», «что — куда», «что — как», «что — где», «что — за что» и др.
В этом предложении не требуется постановка тире. Однако тире может быть поставлено как интонационный знак (при наличии паузы при прочтении).
Запятая ставится.
Возможно единственное и множественное число сказуемого. Подробные рекомендации см. в «Письмовнике».