Лучше обсудить этот вопрос с учителем.
Пишется раздельно: по ошибке.
Верно: В листе учета указывается дата, время прибытия и убытия сотрудника.
Словарь рекомендует писать: в Локте.
Обе запятые нужны.
Действительно, такой оборот вносит интонацию непринужденной разговорной речи. Поэтому он не везде уместен: чтобы принять решение, нужно оценить стиль всего текста.
Запятая поставлена правильно.
Да, запятая нужна, так как нужно закрыть придаточное предложение.
Очевидно, программа пытается связать существительное остановки с ближайшим к нему предлогом для, не «понимая», что этот предлог находится внутри распространенного определения обязательных для данного маршрута (и, соответственно, относится к существительному маршрут) и что существительное остановки связано с предлогом на.