Души не чаять в ком-чём - очень любить кого-, что-л. Выражение "в душе не чаю" литературной норме не соответствует.
Верно: более семисот трудов; такой науки, как экология.
Сочетание "Где ты есть?" в принципе возможно, однако достаточно: Где ты?
В этом случае запятая между частями сложносочиненного предложения не ставится (синтаксически обе части - вопросы).
Сложно дать ответ, не зная предложения целиком. О пунктуации при словах в случае см. в "Справочнике по пунктуации".
Количественные числительные пишутся без наращений: в каждой из 4 зон. А если это не специальная или справочная литература, лучше писать словом: в каждой из четырех зон.
Вы написали верно: изолятор "Матросская Тишина".
Предлоги из – с являются антонимами предлогов в – на, например: поставить книгу в шкаф – взять книгу из шкафа, положить книгу на полку – взять книгу с полки. Поэтому, раз мы говорим иду в школу, то верно: звоню из школы.
Использовать предлог со в данном случае ошибка.
Оптимально: жители города Ногалес.
Тавтологию желательно устранить. В некоторых контекстах возможна такая замена: представлено в гравийном исполнении.
