Вы написали верно: В первой половине 1980-х годов экономический эффект от более чем 1000 [тысячи] научных проектов составил 97 миллионов рублей. Мы не уверены, что экономический эффект исчисляется в суммах, но это уже вопрос не к лингвистам, а к экономистам.
Конструктивно все верно, но, возможно, стоит сказать как-то проще?
Верно: два и более коллектива.
Нет, после количественных числительных наращение не требуется. Правильно: не более 4 часов в сутки.
Вас интересует, какой вариант предпочтителен? Это вариант флигеля. Вариант флигели существует на правах допустимого.
Такое сочетание некорректно. Правильно: выразить протест или оказать сопротивление, например.
Оба варианта верны.
Обе формы некорректны. Возможный вариант: более чуждый.
Нет, так сказать нельзя. Можно заменить на более важный.