Обособление оборота с производным (непервообразным) предлогом с учетом факультативно. Решение обычно принимается с учетом контекста целого предложения или фрагмента.
Для принятия верного решения в таких случаях нужно обращаться к правоустанавливающим документам. В соответствии с ними корректно с прописной: Департамент ветеринарии Минсельхоза России.
Склоняются. Все мужские фамилии, оканчивающиеся на согласный (кроме фамилий на -ых, -их), склоняются.
Подробнее о склонении фамилий вы можете прочитать здесь.
Нет, аббревиатуры, оканчивающиеся на согласный, обозначающие приборы, автомобили, механизмы, их марки и т. п. с добавлением числового показателя, не склоняются.
Да, склоняется: система, разработанная оружейником С. Крнкой.
Правильно: средства от продажи автомобиля.