Правильно: (сделать что-либо) в течение двух недель.
Правильно: в течение многих лет Вы возглавляете.
Правильно: сушенные в течение часа фрукты. Есть зависимые слова, поэтому сушенные — причастие, пишем две буквы н.
Коль скоро слово не зафиксировано в словаре, то говорить о норме в его написании не приходится. В печати встречаются оба варианта, но более частотен вариант стационарозамещающая.
В целом фраза корректна, хотя прилагательное бюджетные очевидно избыточно, коль скоро средства выделяются из федерального бюджета. Предпочтительно: В рамках Соглашения из федерального бюджета выделяются ассигнования в размере *** рублей.
Да, слово боль имеет формы множественного числа (ударение в них остается на корне: болей, при болях).
Тире ставится перед это (присоединяет сказуемое к подлежащему).