Нарушение порядка слов — это синтаксическая ошибка.

Указанная запятая не требуется.

Запятая нужна, она отделяет деепричастный оборот.

Вас не случайно смущает употребление сочетания в том числе в этом предложении. И дело не только в пунктуации. Словари говорят, что это сочетание является союзом и используется «для присоединения слов, использующихся для обозначения, выделения человека или предмета, на к-рые среди прочих (прочего) распространяется сказанное в предыдущей части», например: Пришли все, в том числе и Мухин. Многие сотрудники, в том числе он, сейчас в отпуске. В таких случаях в том числе открывает собой присоединительный оборот. 

В приведенном Вами предложении нет присоединительного оборота. Сочетание в том числе здесь используется в значении, не зафиксированном словарями, — в значении ‘не только, но и’. Здесь оно показывает, что помимо того, о чем говорится в предложении, подразумевается что-то еще (в Вашем случае — что документация может быть представлена и в других формах, помимо формы интерактивных руководств). Подобные случаи в справочниках не рассмотрены, о чём пишет М. М. Харченко в статье, посвящённой нерешённым проблемам современной пунктуации. Судя по приводимым в статье примерам, в большинстве случаев знаки препинания при таком «самостоятельном» в том числе не требуются. Полагаем, что не требуются они и в Вашем примере.

Если далее не следует противопоставление, то верно слитное написание во всех указанных примерах.

В этом предложении дополнительные знаки препинания не нужны.

Порядок слов в названиях улиц, переулков и под. может варьироваться в некотрых пределах. В тексте следует соблюдать прямой порядок: 1-й переулок Пушкина или Первый переулок Пушкина. В списке (например, в словаре, реестре, то есть там, где предполагается поиск по алфавиту) на первое место выносится основной компонент названия: Пушкина 1-й переулок. Образцовый словарный порядок можно найти в «Словаре улиц Москвы».