Уместно разделить запятыми все определения, считая такие определения однородными.
Оборот в связи с этим обособлять не нужно. Если второе полугодие 2016 г. – это и есть отчетный период, то лучше так: В связи с этим ввод данных в ГАС Управление за следующий отчетный период (2-е полугодие 2016 г.) станет доступен с 01.01.2017.
«Большой орфоэпический словарь русского языка», размещенный на нашем портале, приводит ударение на две́ри (не рекомендуется на двери́).
Корректно: кнопка «Стоп», световой указатель «Выход».
Запятая не нужна. Подробнее о пунктуации при слове значит см. в «Справочнике по пунктуации».
Правильно слитное написание: невводом. Не пишется слитно с существительными, если нет противопоставления.
Корректны все приведенные Вами варианты.