С собственно языковой точки зрения эти сочетания очень близки по значению. Слово оправданный имеет значение 'целесообразный', слово обоснованный значит 'подкрепленный убедительными доводами'. В толковых словарях приводится обычно сочетание оправданный риск. Анализ этих сочетаний с правовой точки зрения не входит в нашу компетенцию.
При причастии подготовленные имеется зависимое слово (наречие) теоретически, поэтому корректно раздельное написание: Не приступайте к тестированию не подготовленными теоретически.
Корректно раздельное написание: научно обоснованный.
Слово теоретически, логически не требует обособления.
Такое написание верно, если имеется в виду, что они должны быть разумными. Если же тарифы "требуется обосновать" (сохраняется глагольное значение), то правомерно писать с одной буквы Н: Тарифы должны быть обоснованы не позднее пятого марта!
Правильно.
Верно: экономически необоснованны и экономически не обоснованы; не взаимосвязаны с другими программами.