Правило таково: слова, обозначающие участки течения рек, пишутся со строчной буквы, если не входят в состав названий, напр.: верхняя Припять, нижняя Березина, но: Верхняя Тура, Нижняя Тунгуска (названия рек). Поэтому корректно: нижний Енисей, средний Енисей, верхний Енисей.
Вы написали верно: в кавычках, оба слова со строчной.
Верно написание с мягким знаком.
Такие мужские фамилии склоняются (Фибиха, Фибиху и т. д.), а женские не склоняются.
Верно: Сестра теряет терпение и, будучи суетливой, бежит навстречу.
Запятая нужна, здесь присоединительный союз И (в знач. "и к тому же").
Написание зависит от того, как официально зарегистрировано название центра. В любом случае название следует писать в кавычках.
Нет, запятую ставить не надо.
Поставьте запятую перед союзом "будто".
Ударение на втором слоге: Иисус Навин. См.: Агеенко Ф. Л. Словарь собственных имён русского языка. М., 2010.