Случаи, когда написание, принятое в официальных документах, отличается от зафиксированного в словарях русского языка, не редкость. Академический «Русский орфографический словарь» (4-е изд. М., 2012) фиксирует слитное написание: особоохраняемый.
Лучше с многоточием, чтобы показать, что название приведено не полностью. Впрочем, если полное название в тексте указано (т. е. оно известно читателю), можно обойтись и без многоточия.
Запятые расставлены правильно.
Запятая не нужна.
Вселенная пишется с большой буквы как астрономический термин (в знач. «космос, мироздание»): строение Вселенной, тайны Вселенной. В знач. 'вся земля, все страны' это слово пишется с маленькой буквы.
Союзная конструкция: не только... но и.
Удалю, удалишь... У глаголов совершенного вида единая форма настоящего-будущего времени.
При желании можно разделить на любое количество групп.
Это поговорка.
Здесь буквально: когда берег виден, просматривается.
