2. Правильны оба варианта.
Предпочтительно: В комплект телефона входят две дополнительные крышки.
В этом случае сочетание: две души. Числительное два (две) требует формы единственного числа родительного падежа, поэтому ударение падает на и: две душИ.
Верен первый вариант.
Следует переформулировать. Например: Это были две девочки, подростки.
В данном случае мы имеем дело с причастием вязанный, которое имеет зависимое слово — обстоятельство образа действия крючком.
О двух альтернативных вариантах в принципе можно сказать "две альтернативы", хотя такое словоупотребление и является новым, не вполне закрепившимся в русском языке.
Корректно с одной буквой н. См. рекомендацию Академического орфографического ресурса «Академос»: истрёпанный; кр. ф. -ан, -ана.
Две Л пишутся в соответствии с написанием в языке-источнике.
