Знаки препинания стоят верно.
Да, ставится: В суп сгодится всё, что есть.
Слова про машинки могут выступать в роли пояснения («та игра, а именно игра про машинки») и обособляться: Из готовых работ пока имеется та игра, про машинки, с урока информатики.
Но это необязательно. Если пояснительной интонации нет, то запятые не нужны: Из готовых работ пока имеется та игра про машинки с урока информатики.
Запятая нужна, поскольку здесь есть прямое сравнение.
Здесь называется — сказуемое. Сочетание сходил за хлебом, представляющее собой неполное предложение, выступает в несвойственной ему роли при сказуемом, поэтому его нужно заключить в кавычки: Это называется «сходил за хлебом».
Здесь лишнее слово "сам".
Запятая ставится перед словами "по которым".
Предлог насчет в значении "относительно; о" пишется слитно.
Микроорганизм — неодушевленное существительное, поэтмоу верно: устранять вредоносные микроорганизмы.
Форма глагола верна.
