Правильно: Верховный главнокомандующий (см.: В. В. Лопатин, И. В. Нечаева, Л. К. Чельцова. Прописная или строчная? Орфографический словарь. М., 2007).
Слово уже распадается на два слога. Гласная может представлять собой слог.
С прописной буквы нужно писать только первое слово.
Всё правильно, различия не упразднены. Собирательные числительные не употребляются со словами женского рода.
Запятая не нужна. Если вводное слово стоит в начале обособленного оборота – запятые ставятся перед вводным словом и после всего обособленного оборота. После вводного слова запятая не ставится.
Правильно: надето.
В некоторых случаях деепричастие не думая может сближаться по значению с наречием и не обособляться.
Слово по-видимому не используется как обстоятельство, только как вводное слово.
Корректно: ученый – аналитик данных.
Микроорганизм — неодушевленное существительное, поэтмоу верно: устранять вредоносные микроорганизмы.