Да, поясняющее приложение нужно отделить запятой или тире: У него был верный друг — щенок Шарик; У него был верный друг, щенок Шарик.

Придаточная часть состоит из союзного слова как и акцентирующей частицы именно. Её нужно отделить запятой: Научить пользователей работать с этим и показать, как именно.

Запятые в предложении не требуются. Последнюю часть можно отделить с помощью интонационного тире: ...моментов приятных и безмятежных — и самых прекрасных на свете цветов!

В этом сложном предложении три части, которые необходимо отделить друг от друга знаками препинания. Предпочтительно такое оформление: Если вас не устроит товар — приносите, мы обменяем. 

Запятая перед соответственно не нужна. Сказуемое лучше поставить в форму множественного числа, а знак % отделить пробелом: Чувствительность и специфичность метода составили 62,5 % и 60,8 % соответственно.

Корректно: Например, то, что сегодня понедельник. После слова например следует поставить запятую, так как оно вводное; перед союзом что запятую необходимо поставить, чтобы отделить придаточную часть от главной.

Однородные определения следует отделить друг от друга запятыми: Хранить в сухом, защищенном от прямых солнечных лучей, недоступном для детей месте при температуре от 5 до 25 °C.

Это предложение сложноподчиненное, с двумя однородными придаточными частями в интерпозиции (внутри главной). Придаточные части соединены одиночным союзом и, поэтому не разделяются запятыми, но их необходимо отделить от главной части.

Пунктуация при обороте от... до... не кодифицирована. В Вашем случае этот оборот служит пояснением к сочетанию полный цикл работ, поэтому его уместно, как любое пояснение, отделить запятой или тире.

Знаки препинания расставлены корректно. Если необходимо отделить друг от друга две части предложения, можно добавить в начале второй части слово это: Сотрудники, которые занимаются спортом, — это, как правило, люди организованные.