Сан-... – первая часть геогр. и др. наименований, пишется через дефис, напр.: Сан-Марино (государство), Сан-Ремо, Сан-Сальвадор, Сан-Себастьян, Сан-Диего, Сан-Хосе (города), Сан-Паулу (город и штат), Сан-Карло (собор и театр)
сан... – первая часть сложных слов (сокр.: санитарный), пишется слитно
САН... Первая часть сложных слов, которая может быть выделена сильным ударением при определённых условиях во фразе, напр.: При работе в зоне эпидемии необходимы не только врачи общего профиля, но и санврачи.