зави́симый
незави́симее*
вну́тренне незави́симый
лине́йно зави́симый
лине́йно незави́симый
Ответы справочной службы
Слитное написание, которое Вам встретилось в книгах, – не ошибка. Невидимый – прилагательное, а наличие зависимых слов на слитное написание не с прилагательными не влияет.
Игорь, приведенный Вами пример можно оставить и без частицы НЕ, при этом неоднозначность не исчезнет: Ураган вызвал шторм. Так что такая версия вряд ли обоснованна. Напротив, старая норма предписывала использовать только родительный падеж при отрицании в подавляющем большинстве случаев.
Сама грамматическая проблема выбора падежа довольно сложная, имеет долгую историю. На эту тему существует множество научных исследований. Библиографию можно найти, например, в следующем издании: Граудина Л. К., Ицкович В. А., Катлинская Л. П. Словарь грамматических вариантов русского языка. М., 2008. С. 44-45.
А здесь - о современном употреблении: http://gramota.ru/spravka/letters/?rub=otr
Верно слитное написание. Наличие зависимых слов не оказывает влияния на то, как пишется не с прилагательными.
Да, написание должно быть разным в этих случаях.
Корректно без запятой: Ваш Василий Иванович.
Справочники
НЕЗАВИСИМО ОТ (чего), предлог Обороты, присоединяемые предлогом «независимо от», обычно обособляются (за исключением тех случаев, когда оборот входит в состав сказуемого или тесно связан с ним по смыслу). Независимо от стихотворных упражнений в барковском духе, он начал попивать и охотно подкарауливал в коридоре горничных девок. М. Салтыков-Щедрин, Господа Головлевы. Независимо от сообщения об ялтинском самозванце, Варенуха опять принялся по телефону ...
...НЕЗАВИСИМО ОТ (чего), предлог Обороты, присоединяемые...
...предлогом «независимо от», обычно обособляются...
...Независимо от стихотворных упражнений в барковском...
НЕЗАВИСИМО ОТ ТОГО, ЧТО, союз Придаточные предложения, присоединяемые союзом «независимо от того, что», выделяются (или отделяются) запятыми. При этом первая запятая обычно ставится не перед союзом, а между его частями (перед словом «что»). Оставалась одна Евпраксеюшка, но независимо от того, что это был ресурс очень ограниченный, и в ней произошла какая-то порча, которая не замедлила пробиться наружу... М. Салтыков-Щедрин, Господа Головлевы. Он не знал еще и того, что ...
...НЕЗАВИСИМО ОТ ТОГО, ЧТО, союз Придаточные предложения...
..., присоединяемые союзом «независимо от того,...
...Оставалась одна Евпраксеюшка, но независимо от того...
Журнал
Даже те, кто этого не хотел, наверняка слышали песню «Сигма-бой» или хотя бы знают о ней. Кто такие сигмы, какие качества отличают этот мужской тип и почему сигмы стали популярнее альф?
...Даже те, кто этого не хотел, наверняка слышали...
...Что это значит Сигма — успешный, независимый...