Сочетание функционирует как название и закреплено в академическом орфографическом словаре.
Верно: кальмар дальневосточный.
Обе аббревиатуры корректны.
Если возникает необходимость написания подобных прилагательных с прописной буквы, то слитное написание меняется на дефисное. Правильно: Северо-Кавказский военный округ. Однако Дальневосточный пишется слитно, т. к. существительное восток не является именем собственным.