Да, эта фраза лексически избыточна.
Корректно: племенное свидетельство или эквивалентный документ, выданнЫЙ уполномоченным органом.
См. в Словаре трудностей.
Лучше перестроить фразу, например: Это касается не только плоских, но и объёмных предметов.
Можно поставить двоеточие.
Следует обособить: орган, принявший документ.
Правильно: Муамар Каддафи.
Такой вариант возможен. В его пользу говорит тот факт, что слово упаковывание - однозначное в современном русском языке; оно обозначает "действие по глаг. упаковывать". В отличие от него, слово упакова многозначное - это и действие, и материал, в который что-либо упаковывается.
Да, нормами русского языка закреплено стяженное (редуцированное) произношение отчеств. Например: Николай Николаич, Максим Максимыч, Марья Алексевна, Ольга Николавна, Александр Василич. Это норма для звучащих текстов неофициального характера; в официальной речи принято полное произношение имен и отчеств.
В доступных нам словарях это слово не зафиксировано.