Предпочтительно: Они прошли огонь, и воду, и медные трубы. Отсутствие запятых может указывать на то, что первые два однородных члена предложения образуют интонационно-логическое единство.
Нет, запятые не нужны.
Усилительная частица ну не требует постановки знаков препинания.
Да, обособление корректно.
Запятая не ставится. См. о таких случаях «Справочник по русскому языку. Пунктуация» Д. Э. Розенталя, примечание 1 к параграфу 48.
Запятая не нужна, так как нет оснований для обособления дополнения для установки.
Тире не нужно.
Возможен либо тот, либо другой парный знак.
Верно: Паровоз, или локомотив, — один из видов транспорта.
Междометия отделяются запятыми. Как вариант, можно выделить междометие в особое предложение: Догадываешься, сколько у него получилось? Ага! Три с половиной!