Слова как минимум обычно обособляются как вводные, если стоят в конце предложения: Соискатель должен знать три языка, как минимум. Если слова как минимум стоят в середине предложения, то они не выделяются знаками препинания: Соискатель должен знать как минимум три языка.
Да, правильно.
Правильно: расчет пеней.
Слова может быть обособляются, если они выступают в предложении в роли вводных слов.
Нет, не нужно.
Запятую ставить не нужно.
Предпочтительно: не понял сути.
На худой конец – в крайнем случае.
Если для постановки запятой существует отдельное пунктуационное основание (например, нужно закрыть деепричастный оборот), то запятая ставится и перед тире.
Сам по себе союз никогда не является основанием для постановки знаков препинания, в том числе запятых. Запятая разделяет предикативные части сложноподчиненного предложения, а не является атрибутом союза.