Выражение "углубление знаний" вполне корректно, а вот оборот "знания по работе с... системами" не годится.
Сами по себе эти слова не требуют обособления. Но пунктуация зависит от строя конкретного предложения.
Нет, не является.
Такое сочетание трудно назвать корректным. Предотвратить – предупредить; сделать невозможным возникновение чего-либо. Возникший конфликт – такой, который уже возник. Корректно: предотвратить конфликт.
Для поиска контекстов Вы можете воспользоваться Национальным корпусом русского языка: ruscorpora.ru
Сочетание избыточно. Возможный вариант: внутренняя жизнь компании.
Корректно: Ну-ка, ну-ка, что это?
Сочетание корректно. Уместность зависит от контекста.
Зависит от контекста, чаще пишется без кавычек.
Предлог здесь лишний. Верно: параллельны друг другу.