В каждом слове по два суффикса.
В отличие от союза, союзное слово выполняет функцию члена предложения. Ср. употребление союзного слова что и омонимичного ему союза что: "Сам не знаю, за что я люблю тебя, ночь" (Полонский) и "Не отнеси к холодному бесстрастью, Что на тебя безмолвно я гляжу" (Фет).
Это такой способ образования слова, когда производное слово не отличается от производящего (производящих) по набору и количеству морфем, ср.: гостиная (прил.) - гостиная (сущ.).
В отличие от союза, союзное слово выполняет функцию члена предложения. Ср. употребление союзного слова что и омонимичного ему союза что: «Сам не знаю, за что я люблю тебя, ночь» (Полонский) и «Не отнеси к холодному бесстрастью, Что на тебя безмолвно я гляжу» (Фет).
Это исторически родственные слова, но в современном языке они уже не являются однокоренными.