С точки зрения системы современного русского языка в слове Смирнов выделяются корень смирнов- и нулевое окончание. С исторической точки зрения в этом слове можно выделить приставку с-, корень мир-, а также суффиксы -н- и -ов- + нулевое окончание.
Корень, суффикс, нулевое окончание: шест-надцать-0, сем-надцать-0.
Верно: Включить в состав фонда сто тридцать два предмета, зарегистрированные в книге учета.
Согласно словарю А. Н. Тихонова, в этом слове приставки в- и за-, корень -перт-, окончание -и.
Слово первозданный образовалось в результате сращения слова пьрво (в значении ‘сначала, прежде’) и слова зьданьныи – ‘созданный’ (от зьдати ‘строить’, родственные слова – здание, зодчий). Но это история слова. В современном языке слово первозданный можно считать непроизводным и выделять корень -первозданн- , так как смысловая связь со словами здание, зодчий уже утрачена.
Запятая нужна: ароматизаторы, идентичные натуральным.
Являющемся – форма предложного падежа, являющимся – творительного. Правильно: Состав работ приведён в задании, являющемся приложением к договору. Ср.: Руководствоваться заданием, являющимся приложением к договору.
Запятую можно поставить, но она необязательна.
Ошибка состоит в том, что в первом предложении употреблены глаголы разных видов: совершенного (сделать), который указывает на завершенность действия, и несовершенного (страдают), который указывает на продолжаемость действия.