Это предложение по цели высказывания не вопросительное, а побудительное: его грамматическую основу составляет глагольная форма повелительного наклонения подскажите. Соответственно, вопросительный знак в конце этого предложения не нужен.
Верно: с девяноста тысячами жителей.
Сочетание город-побратим, обозначающее статус какого-либо города относительно другого города, является терминологическим, а потому рекомендуем писать его через дефис даже в тех случаях, когда при нем есть зависимые слова: город-побратим Москвы.
Много болот плюс нулевая формальная связка (ср. в прош. вр.: В России было очень много болот).
В этом предложении сравнительный оборот играет роль сказуемого, запятая между подлежащим и сказуемым не ставится.
Оба прилагательных возможны, но лишь в разговорной речи.
Здесь значит выступает в роли союза: Если город строится, значит город живёт! Подробнее см. "Справочник по пунктуации".