Указанная запятая не ставится.
Употребление прописных и строчных букв в названиях войн в целом подчиняется правилу о названиях исторических эпох и событий, календарных периодов и праздников, общественных мероприятий.
Отдельные написания являются словарными. Так, орфографический словарь В. В. Лопатина, И. В. Нечаевой, Л. К. Чельцовой «Прописная или строчная?» (М., 2011) рекомендует написание «опиумные войны». Рекомендация, по-видимому, обусловлена тем, что название не типично, оно воспринимается как не вполне название, скорее описательный оборот, используемый в функции названия. Ср. типичные названия для войн: Итальянские войны, Балканские войны, Альбигойские войны, Гуситские войны, Наполеоновские войны, Пунические войны, Греко-персидские войны.
Сокращенные наименования министерств пишутся с большой буквы: Минрегион, Минздрав, Минфин и т. п.
При отсутствии родового слова корректно написание с большой буквы, без кавычек.
Да, склонять такие названия нужно, если они не используются в функции приложения (например: состав препарата "Супрадин").
Склоняются, однако при употреблении с родовым наименованием Кемерово склонять не следует: в городе Кемерово.
Инициальные аббревиатуры – названия спортивных организаций обычно не заключаются в кавычки.
Да, названия железнодорожных станций, вокзалов пишутся без кавычек. Названия станций метро, остановок наземного городского транспорта заключаются в кавычки (в текстах, но не на картах и схемах и не на самих станциях и остановках).
Наименования специальностей, в том числе научных, пишутся со строчной буквы.
Бытовые названия (сморчки, подберезовики, подосиновики и т. п.) пишутся со строчной буквы.