В названиях, состоящих из родового наименования и наименования, не сочетающегося с ним синтаксически, последнее заключается в кавычки и в нем пишутся с прописной буквы первое (или единственное) слово и собственные имена, поэтому правильно: ГЭС «Байхэтань», ГЭС «Три ущелья».
Сочетание без понятия — сниженный элемент разговорной речи. В строгой литературной речи он неуместен.
Корректно написание без кавычек (название этой организации ассоциируется с государственной структурой). Если есть родовое слово, кавычки нужны. Подробнее см. в «Письмовнике».
Запятая не нужна, т. к. есть общий второстепенный член без этого.
Знаки препинания не требуются.
Можно и нужно. Запятая не ставится, если придаточное предложение состоит из одного только союзного слова.
Да, правильно слитное написание. Приставка суб... пишется слитно.
Верно: в 2014 году, в 2014-м.
Правильно: заведующая музеем-мастерской.
Альфа-... - первая часть сложных слов, пишется через дефис, но: альфаметр, альфатип, альфатрон. Должно быть: альфа-ритм.