Семена, орехи и грибы — подлежащее, корм — сказуемое.
Предпочтительно: реки Томи.
В названии реки произносится [тэ].
Буква ъ может писаться при передаче иноязычных собственных имен после букв, обозначающих парные твердые согласные, перед я, е, ё, ю и даже и. См. § 27 в «Правилах русской орфографии и пунктуации» под ред. В. В. Лопатина.
Сочетание некорректно. Верно: методы оценки рисков и управления ими.
Зависит от того, какого стиля речи партнеры придерживаются в переписке. В официально-деловом стиле такая формулировка недопустима. В непринужденной речи вполне уместна.
Правильно: критерии оценки (им. п.), критериев оценки (род. п.).
Верно: оценке. Форма предложного падежа единственного числа I склонения требует окончания -е.
Знаки препинания стоят верно.