Оба способа передачи этого слова буквами русского алфавита возможны.
Лучше бы "фи" написать буквой греческого алфавита, без кавычек.
Правильное название: йотированные (по названию буквы латинского алфавита йот).
Изучение русского языка стоит начать с алфавита и правил чтения.
Эту марку склонять нужно (при записи буквами русского алфавита): очарование "Шкоды".
Лучше написать латиницей, но при написании буквами русского алфавита уместно будет поставить дефис.
Инициалы – это графические сокращения имени и отчества. Графическое сокращение означает, что при прочтении слово читается полностью: мы не читаем [и-и-иванов], мы говорим либо просто Иванов, либо Иван Иванович Иванов.
В живой речи имя и отчество практически всегда предшествует фамилии (исключение – бюрократическая, канцелярская речь). Хорошая традиция – перенести этот принцип и в письменную речь.
Естественно, исключением останутся пофамильные алфавитные перечни, в которых фамилия играет организующую роль и предшествует инициалам.
Кавычки в данном случае нужны, так как в состав названия входит слово, написанное буквами русского алфавита.