Конструкция (и) зря, что используется в разговорной речи и в художественных текстах, например: Когда срываешь масленок, или сыроежку, или даже рыжик, не приходит в голову понюхать его, втянуть в себя острый и тонкий аромат гриба, бог весть где найденный им в земле и собранный на хранение. И зря, что не приходит в голову, ибо очень душист масленок, прекрасно пахнет рыжик, благоухает опенок, поражает запахом шампиньон. [Владимир Солоухин. Третья охота (1967)].
Верен первый вариант. См. раздел Согласование сказуемого с числительными в Письмовнике.
Это формы винительного падежа.
Употребление местоимения их по отношению к неодушевленным предметам вполне корректно.
Запятая перед как стоит верно. Дополнительные запятые не требуются.
Обороты «несмотря на + существительное» обычно выделяются знаками препинания: Как удвоить продажи, несмотря на кризис?
Это словосочетание пишется строчными буквами.
