Наличие или отсутствие запятой зависит от текста преамбулы (запятая ставится по условиям контекста).
Допустимо.
В значении "ради изменения" верно: во изменение.
Запятая после обстоятельственного сочетания на основании приказа факультативна. В данном случае без запятой непонятно, к чему относится сочетание в целях совершенствования процедур входного контроля — к слову приказа или к слову приказываю. Если верен последний вариант, то запятую нужно поставить во избежание разночтений.
Обороты с предлогом в соответствии с факультативно выделяются запятыми. В данном случае запятую лучше поставить (особенно если названия закона и постановления длинные), чтобы обозначить границы оборота. Но отсутствие запятой не будет ошибкой.
Обособление оборота в целях... факультативно.
См. «Горячие вопросы».