Название этой госкорпорации заключается в кавычки.
Верная пунктуация:
При этом на отчетной неделе российские информационные ресурсы международных экологических организаций комментировали, помимо вопросов ЯРБ, также и экономические аспекты проектов и сделок ГК «Росатом» с зарубежными партнерами.
Нормативно написание со строчной буквы.
Подобные сокращения существуют. Например: Роспечать (Федеральное агентство по печати и массовым коммуникациям), Росатом (Федеральное агентство по атомной энергии).
Фамилии стоят в нужном падеже.
Если нет родового слова, такие названия нужно склонять как обычные существительные.