Ответы справочной службы
В данном предложении запятая перед первым союзом и не требуется. Однако оно требует некоторой корректировки: Обращаю Ваше внимание на то, что вышеуказанные пункты отсутствуют в проекте либо выполнены не в полном объеме и что при их предоставлении и последующем рассмотрении могут быть выявлены новые замечания.
Возможны оба варианта (только в первом случае не пишется слитно), чаще используется: в неполном объеме.
Указанная запятая нужна.