Нет, в этом случае не сравниваются результаты ученика с результатами одноклассников. Речь идет о собственных успехах ученика, о том, что его собственные результаты (оценки) перестали, условно говоря, контрастировать и выровнялись.
Здесь верно: выровнялась.
В значении "стать одинаковыми, равными" - выравняться.
Верно: Вспомнить три года учебы, проведенные вместе.
Запятая поставлена верно. Но и ее отсутствие не будет ошибкой: обособление оборотов с предлогом благодаря факультативно.
Верно: На учете в полиции состоит около 1000 неблагополучных семей.