Предпочтительно: мной, но допустим и вариант мною.
Оба варианта верны.
Предпочтительный вариант: мной, вариант мною допустим, но считается устаревшим.
Оба варианта возможны: Список книг, прочитанных мной за это время и Список книг, прочитанных мною за это время. Но при этом предпочтительный вариант: мной. Вариант мною допустим, но считается устаревшим.
Предпочтительно: мной, но допустим и вариант мною.
Предпочтительно: мной.
Запятая нужна, знаки препинания расставлены верно.
Заместитель заведующего дневным отделением.