Обособление факультативно (постановка запятой зависит от степени распространенности оборота и его места в строе предложения).
В приведенном примере выделяются как вводные.
Эти слова не являются вводными и обычно не обособляются.
Запятые нужны.
Как правило, слова тем не менее не выделяются. В приведенном примере корректно без запятой.
Обстоятельственные обороты с предлогом в случае могут обособляться по условиям контекста.
Слово вероятно может быть вводным (в значении 'по-видимому, наверное') и выделяться запятыми: он, вероятно, сегодня уже не придет, а может выступать и в функции сказуемого, в этом случае вероятно не обособляется: весьма вероятно, что сегодня он уже не придет.
Обособление факультативно.
Сочетание в основном не требует постановки знаков препинания. Однако если в основном начинают собой присоединительный оборот, то они выделяются вместе с относящимися к ним словами, т. е. ставится запятая перед ними.
Спасибо за замечание. Ответы исправлены.
Выделение особенно корректно.
