См. здесь.
Запятые нужны.
Ударение остается на корне: бутыли.
Слово Берлин лучше написать в скобках: Анна Фогель (Берлин) разработала методику...
Словарной фиксации нет. Корректно писать через дефис.
См. вопрос 221381.
Правильно: Малага. См.: Агеенко Ф. Л. Словарь собственных имён русского языка. М., 2010 (электронная версия – на нашем портале).
Ударение в названиях Базель и Марсель сравнивать некорректно, т. к. эти названия пришли из разных языков: Базель – из немецкого, Марсель – из французского (в котором ударение всегда на последнем слоге). Кроме того, ударение в иноязычных географических названиях в одних случаях соответствует ударению в языке-источнике, а в других побеждает традиционный для русского языка вариант, отличающийся от оригинала (Вашингтон, а не Уошингтон). Поэтому во всех спорных случаях надо обращаться к словарю.
Правильно раздельно: не суди, да не судим будешь.
Нужно поставить тире.
Правильно: кеглей.