В деловой речи устоялась первая из указанных Вами моделей. Однако она двусмысленна, поэтому в реквизитах деловых документов желательно название должности и организации помещать на разных строчках, а в текстах избегать подобных конструкций.
С чем согласуется филиал? Управляющий филиалом или по бизнесу филиала?
Может быть, заместитель управляющего казанским филиалом по бизнесу?
Следует писать с маленькой буквы.
Правильно: заместитель заведующего МБОУ «Детский сад № 100».
Верно: Докладчик: Иванов Иван Иванович, заместитель генерального директора.
В этом случае приставка экс- по основному правилу присоединяется дефисом: экс-премьер-министр.
Правильно: заместитель управляющего отделением.
Возможно написание и замдиректора (сложносокращенное слово), и зам. директора (графическое сокращение слова заместитель). О различии зам. директора – замдиректора см. в ответе на вопрос № 237554.
Если на основании доверенности действует заместитель директора, то правильно: заместитель (какой?) действующий.
Распространенные приложения обособляются запятыми или тире, одиночные приложения присоединяются к определяемому слову с помощью дефиса, а к словосочетанию с помощью тире. Подробнее см. Правила русской орфографии и пунктуации. Полный академический справочник / Под ред. В. В. Лопатина. М., 2006 (и более поздние издания), разделы «Знаки препинания при обособленных приложениях», «Корректирующие правила».