Запятая не требуется.

См. статьи «Справочника по пунктуации»: кроме того, после того как.

Верно: А кроме того, вы научитесь...

Здесь нет ошибки: в русском языке довольно свободный порядок слов, и части составных союзов вполне могут разделяться несколькими словами, например: Я только тогда бываю спокоен, когда она сидит у меня на коленях и я пою ей: «Ой за гаем, гаем!» (Л. Вертинская). Мы потому так подробно остановились на этой ситуации с проблемой четырех красок, что, знай о ней Витгенштейн, она привлекла бы его внимание (В. Успенский).

Оборот тогда и только тогда — специфическая формулировка, которая используется чаще всего в математике, логике и философии и часто выносится в начало предложения.

Корректно: Будь она мальчиком – тогда пожалуйста, а так....

Предложенный Вами вариант пунктуационного оформления корректен.