Правилен первый вариант.
Указанная запятая нужна.
Запятую ставить не нужно. При интонационном выделении возможна такая расстановка знаков препинания:
Школа в принципе готова принять - и принимает - формирование творческих способностей в качестве заказа.
Предложение построено неудачно. Союз в том числе (и) употребляется для присоединения слов, использующихся для обозначения, выделения человека или предмета, на которые среди прочих (прочего) распространяется сказанное в предыдущей части. В Вашем предложении этой самой предыдущей части нет. Ср. правильно построенные предложения с данным союзом:
Пришли все, в том числе и Мухин.
Многие сотрудники, в том числе Александр, сейчас работают дома.
В строгом смысле человек десять, в том числе и я, не стоили этого назначения.
Приведем некоторые варианты исправления: Задачей Фонда в числе многих других является формирование моральных ценностей человека. Одной из задач Фонда является формирование моральных ценностей человека.
Запятая не нужна: союз и соединяет однородные сказуемые осуществляется и начинается.
Верно слитное написание.
Оборот в соответствии со статьей 60 Градостроительного кодекса РФ (обратите внимание на написание слова кодекс строчными) надо или выделить запятыми с обеих сторон, или не выделять вообще. Одной запятой после этого оборота недостаточно.