Да, запятую надо поставить. Противительный союз, после которого или перед которым находятся два соединенных союзом и простых предложения, не является объединяющим элементом, поэтому запятая перед и ставится.
Правильно: в замене.
Корректно: ...платы как результата... Обратите внимание: предложение перегружено канцеляризмами, которые затемняют смысл, поэтому его необходимо перестроить, например, так: Отчет о выполнении плана мероприятий, направленных на повышение заработной платы.