Корректно: Банк возвращает исполнительный лист, выданный Гагаринским районным судом (лист — какой? — выданный).
Аббревиатура ВЦИК в строгой деловой письменной речи не склоняются. Подробнее см. в «Письмовнике».
Запятая перед только нужна.
Запятая нужна, так как это сложное предложение.
Корректно: первый вице-президент – исполнительный директор Иванов.
Корректно: ...набор учащихся в 9-е классы или набор учащихся, окончивших 9-й класс.
Приведенный Вами вариант написания корректен.